睡覺醒來眼睛疼可能是由多種原因引起的，如用眼過度、睡眠姿勢不當、眼部感染、干眼癥、青光眼等。

1. 用眼過度：長時間使用電子設備、閱讀或寫作等，導致眼睛疲勞。應減少用眼時間，每隔一段時間休息一下，可眺望遠方或閉目養神，也可進行眼部按摩。

2. 睡眠姿勢不當：趴著睡或壓迫眼睛，影響眼部血液循環。調整睡眠姿勢，保持正確的睡姿，避免壓迫眼睛。

3. 眼部感染：如結膜炎、角膜炎等，除了眼睛疼，還可能伴有紅腫、分泌物增多等癥狀。需注意眼部衛生，避免用手揉眼睛，可使用相應的眼藥水治療。

4. 干眼癥：淚液分泌不足或蒸發過快，使眼睛干澀、疼痛。可通過增加室內濕度、使用人工淚液等緩解癥狀。

5. 青光眼：眼壓升高引起的眼病，疼痛較為劇烈，還可能伴有視力下降、頭痛等。這種情況需要及時就醫，進行專業治療。

如果睡覺醒來眼睛疼的癥狀持續不緩解或加重，應及時到醫院就診，查明原因，以便進行針對性的治療。在日常生活中，要注意保持良好的用眼習慣，注意眼部衛生，保證充足的睡眠。