角膜不像身體的其他器官一樣，有很多的血管以及淋巴但是會有一定的細胞引起周邊的微小血管淋巴管出現一定的排斥反應植入的角膜抗原，被免疫系統進行識別。所形成的一種應激反應
      

      角膜移植發生排斥是因為發生排斥反應的細胞進入到了移植區域，角膜只是一個相對免疫赦免的部位，它不像肝臟或腎臟一樣有很多很大的血管或淋巴管，所以，體內發生排斥反應的細胞很難進入角膜移植區域，但難以進入不是不會進入，角膜周邊還是有些微小的血管和淋巴管存在的，所以在角膜移植后，是可能發生排斥反應的，故在角膜移植術后，通常要局部使用一些抗排斥藥物，以防止排斥反應的發生。