病毒細菌結核分歧桿菌，真菌等均可引起腦炎，有些具有較強的傳染性。患有乙型腦炎是有傳染性的，經過蚊蟲叮咬傳播，所以病人要注意隔離。同時結核性腦膜炎的患者往往合并其他部位的結核，所以也有一定的傳染性，要注意保護。
      

      大部分腦炎是不傳染，具有傳染風險的腦炎如結核性腦炎（合并播散性肺結核時）、乙型腦炎、HIV腦病、炭疽病等，需要隔離治療。不同的腦炎、不同的患者后果可能不同，不能一概而論。一些較輕的腦炎可能只是引發頭痛、頸痛、頸部僵硬等癥狀，而嚴重者可能會出現精神異常、癲癇、智能障礙、偏癱、大小便障礙等中樞神經障礙表現。