甲亢浸潤性突眼的治療包括注意眼睛休息、戴黑色或茶色眼鏡，避免強光及各種外來刺激，睡眠時用抗菌眼膏并戴眼罩，以免角膜暴露部分受刺激而發生炎癥。用單側眼罩減輕復視，高枕臥位，控制食鹽的攝入，抗菌眼藥膏以及可的松眼藥水交替使用。
      有嚴重的突眼甚至結膜水泡樣膨出，如金魚眼者，應宜迅速進行眼瞼側面縫合術。突眼嚴重及視力受到威脅經局部和全身治療無效時，可采用各種眶內減壓術。
      甲狀腺制劑用于甲亢治程中即伴有明顯突眼者。免疫抑制劑突眼初期三個月應用療效較好。球后或垂體放射治療。球后照射劑應在大劑量糖皮質類固醇治療無效或因有禁忌證不能用皮質激素時考慮應用。
      血漿置換法可以迅速去除血漿中抗眼外肌抗體等抗球后組織自身抗體。特別對病程較短、眼球突出急劇、有軟組織、角膜病變及視力障礙者尤為有效。嚴重突眼且視力受明顯威脅者，應和外科或眼科醫生共同研討手術方案。眼眶后壁及頂部移除術，篩竇后壁和上頜竇頂部切除術常被應用。