腦炎大部分是由病毒感染引起的，有多種類型病毒就會引起腦炎，例如乙腦是由感染乙型腦炎病毒的蚊子叮咬引起。還有一種是單純皰疹病毒，與引起唇皰疹和生殖器皰疹的病毒是同一種病毒，會長期潛伏在神經節中，當機體的免疫力低下，病毒再度活化，經三叉神經進入腦內，引起顱內感染，感染皰疹病毒的母親也可以將病毒傳染給嬰兒。有一部分腦炎是由細菌感染引起，還有可能是由于寄生蟲引起，如引起弓形蟲病的寄生蟲。還有的是由結核感染引起，如結核性腦膜炎，結核性腦膜炎大部分會單獨發病，有的不一定合并有肺結核。
      

      腦炎行成是由于病原體通過血腦屏障進入大腦組織中導致腦組織發炎的情況，懷疑腦炎需要完善腰椎穿刺術化驗腦脊液來確診的，確診后及時給與正規抗感染治療的。