你的情況考慮可能是由于泌尿生殖系統炎癥引起的，也可能是身體上火引起的。如果持續感覺陰莖不舒服建議你最好到當地正規公立醫院泌尿生殖科檢查一下，明確原因后對癥治療為好。

      指導意見：
      可能考慮泌尿系感染，多是逆行性感染，尿痛，尿急，尿頻是膀胱刺激征。建議去醫院化驗一下尿常規，如果癥狀嚴重，或尿常規有白細胞，膿球，考慮感染嚴重，需口服藥物抗感染治療，一般服左氧氟沙星，環丙沙星類藥物。癥狀輕的，不需用藥，平常多喝水，利尿，即可減輕癥狀。

      病情分析：
      你好先生：根據你的描述情況，早晨起來上廁所發現小便呈橘黃色，然后喝完水后好轉，可能與你的飲食吃了帶有染色食物或者喝了有染色的飲料有關。
      指導意見：
      建議你：平時注意飲食少吃帶有染料的食物喝少喝帶有染色的飲料，注意多喝白開水，增加尿液排泄，如果有不適及時就診。
      以上是對“早上起來上廁所上完疼”這個問題的建議，希望對您有幫助，祝您健康！